ACERCA DE

Tu guía para navegar el universo de la citometría de flujo

¿Alguna vez te has maravillado con la idea de poder espiar el universo que se esconde dentro de los sistemas celulares? ¿De clasificar, contar y entender millones de células en cuestión de minutos? Esa es la magia de la citometría de flujo, una técnica que transforma lo invisible en datos, y los datos en conocimiento.

Soy Jairo Villanueva, y durante mis años como investigador, he tenido el privilegio de viajar por este cosmos celular. Este blog nace de esa fascinación y de una convicción profunda: el poder de la citometría de flujo pertenece a todos, desde el estudiante curioso hasta el investigador consolidado. Mi objetivo es servir como guía en este viaje, creando un puente entre la complejidad de la técnica y tu deseo de aprender, utilizando el lenguaje más poderoso y versátil para el análisis de datos: R.

Para asegurarnos de que cada explorador encuentre su camino, he dividido nuestro viaje en dos universos paralelos.

El CITOverso: El mapa estelar del análisis fundamental

Si estás dando tus primeros pasos, sientes curiosidad por los fundamentos o buscas afianzar tus conocimientos en el análisis tradicional, el CITOverso es tu punto de partida. Es nuestro "universo local", donde sentaremos las bases de tu conocimiento.

Aquí aprenderás:

• Los principios básicos de cómo funciona un citómetro.
• A interpretar los clásicos gráficos de puntos bidimensionales (dot plots) que forman la base de todo análisis.
• A desarrollar estrategias de gating manual y aumático paso a paso en R para aislar tus poblaciones de interés.
• A entender conceptos cruciales como la compensación de fluorescencia y la importancia de los controles.

El CITOverso es tu manual de vuelo, diseñado para darte la confianza y las habilidades necesarias para navegar los conceptos esenciales de la citometría con total seguridad.

El multiCITOverso: Conquistando las nuevas fronteras del análisis

Una vez que dominas las leyes de nuestro universo, es hora de saltar a la velocidad de la luz y explorar galaxias lejanas. El multiCITOverso es para los exploradores audaces, aquellos que trabajan con paneles de más de 10 colores y desean extraer hasta la última gota de información de sus datos complejos.

En esta sección nos adentraremos en:

• El uso de algoritmos de clustering (como FlowSOM y PhenoGraph) para descubrir poblaciones celulares de forma no supervisada.
• La aplicación de potentes herramientas de reducción de dimensionalidad (como t-SNE y UMAP) para visualizar datos de alta dimensionalidad de una manera intuitiva.
• Flujos de trabajo avanzados en R para automatizar el análisis, identificar marcadores importantes y realizar análisis estadísticos robustos entre cohortes.

El multiCITOverso es tu portal a la frontera del análisis de datos, donde juntos descubriremos patrones ocultos y poblaciones celulares que el análisis tradicional ni siquiera podría imaginar.

Así que, ya sea que estés aquí para encender la primera estrella de tu conocimiento en el CITOverso o para trazar nuevas y audaces constelaciones en el multiCITOverso, has llegado al lugar correcto.

¡Bienvenido a esta comunidad!

Creado con 🤖 por Jairo Villanueva